Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LbrQ3U9G9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LbrQ3U9G9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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