Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf40Q3U319 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf40Q3U319 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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