Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hvcn1Q3U2S8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms