Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Serac1Q3U213 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms