Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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