Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccndbp1Q3TVC7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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