Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Shcbp1lQ3TTP0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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