Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam107bQ3TGF2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms