Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccbe1Q3MI99 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccbe1Q3MI99 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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