Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms