Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sap25Q1EHW4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sap25Q1EHW4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sap25Q1EHW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sap25Q1EHW4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms