Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc162pQ0VG85 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms