Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms