Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
StumQ0VBF8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms