Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps8Q0P5W1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms