Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TrioQ0KL02 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TrioQ0KL02 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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