Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn2bQ0KL01 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms