Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pate4Q09098 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms