Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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