Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calb2Q08331 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms