Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MestQ07646 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MestQ07646 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms