Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms