Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf3Q07104 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms