Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah2Q06986 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms