Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcad1Q04692 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcad1Q04692 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms