Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnb1Q03717 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms