Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms