Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Runx1Q03347 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Runx1Q03347 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms