Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfr4Q03142 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms