Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GscQ02591 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GscQ02591 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms