Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdcd1Q02242 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms