Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RykQ01887 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RykQ01887 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RykQ01887 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RykQ01887 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms