Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VcpQ01853 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VcpQ01853 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms