Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms