Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HmgcrQ01237 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms