Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelpQ01102 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelpQ01102 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms