Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms