Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga4Q00651 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms