Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp9bP98195 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms