Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pitx2P97474 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms