Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf1bP97358 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms