Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms