Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgcdP82347 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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