Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CiitaP79621 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CiitaP79621 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms