Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbdsP70122 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms