Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vbp1P61759 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vbp1P61759 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vbp1P61759 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vbp1P61759 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vbp1P61759 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vbp1P61759 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms