Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2fP61219 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Polr2fP61219 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2fP61219 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms