Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2d1P61080 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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