Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snap25P60879 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snap25P60879 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snap25P60879 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snap25P60879 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms