Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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ActbP60710 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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ActbP60710 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ActbP60710 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ActbP60710 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms